論理障害の一番多い障害はやはりWINDOWSが起動しないシステムファイルのトラブルなどです。MBRの異常・消失が発生するケースがあります。パソコンの電源を入れると最初にROMに記録されているBIOSが起動します。

ここで問題がなければBIOSはブートディスクを探します。これを「BOOT　SEQUENCE」と呼び、通常はFD、CD-ROMまたはハードディスクです。ブートディスクが決まると最初にセクターを読み込みます。

この最初のセクターのことを「MBR（マスターブートレコード）」と呼び、ここにOSの起動プログラムが記録されています。MBRはハードディスクの一番最初のセクターで512バイトです。このMBRが壊れてしまうとパソコンはOSを起動することができなくなります。MBR等の論理障害を起こすと下記、エラーメッセージが表示されます。

「OPERATING SYSYEM NOT FOUND」
「NTLDR is missing Press Ctrl+Alt+Del to restart」
「DISK BOOT FAILURE～」とエラーメッセージが表示されます。

OSが入っているパソコンの場合、上記のようなエラーメッセージが表示されますが、ＯＳのない、ＵＳＢ接続の外付けハードディスクの場合、「ドライブＤのディスクはフォーマットされていません。 今すぐフォーマットしますか？」などと表示される場合があります。

「ドライブＤ」の箇所はＤとは限らず、ドライブによって変わるため、Ｃ，Ｅなどの他のローマ字になります。

論理障害では、ＯＳのシステムにエラーが発生したり、またはパーテーションの区画情報、およびフォーマットのファイル形式などがエラーを起こすことで発生します。

但し、ハードディスクの記録面に物理的なエラーが発生している場合にも、エラーとなるケースがあります。特定の損傷箇所に読み書きを行った場合に、論理障害が起こるケースもあり、原因が１つだけとは限りません。